Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Mfsd13aQ6PDE8 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mfsd13aQ6PDE8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms