Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trak1Q6PD31 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trak1Q6PD31 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Trak1Q6PD31 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.9 ms