Protein–RNA interactions for Protein: Q6P7W0

Senp6, Sentrin-specific protease 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp6Q6P7W0 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Senp6Q6P7W0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Senp6Q6P7W0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Senp6Q6P7W0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Senp6Q6P7W0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Senp6Q6P7W0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Senp6Q6P7W0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Senp6Q6P7W0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Senp6Q6P7W0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Senp6Q6P7W0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Senp6Q6P7W0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Senp6Q6P7W0 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms