Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5U8

Ccdc148, Coiled-coil domain-containing protein 148, mousemouse

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Length 527 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc148Q6P5U8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc148Q6P5U8 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc148Q6P5U8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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