Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Atg2aQ6P4T0 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Atg2aQ6P4T0 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Atg2aQ6P4T0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms