Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2K6

Ppp4r3a, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3A, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp4r3aQ6P2K6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ppp4r3aQ6P2K6 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ppp4r3aQ6P2K6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms