Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZQ2

Ddx31, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx31Q6NZQ2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ddx31Q6NZQ2 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ddx31Q6NZQ2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms