Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZN1

Pprc1, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pprc1Q6NZN1 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Pprc1Q6NZN1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pprc1Q6NZN1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pprc1Q6NZN1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pprc1Q6NZN1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pprc1Q6NZN1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pprc1Q6NZN1 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Pprc1Q6NZN1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pprc1Q6NZN1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pprc1Q6NZN1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pprc1Q6NZN1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pprc1Q6NZN1 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pprc1Q6NZN1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pprc1Q6NZN1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms