Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SphkapQ6NSW3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SphkapQ6NSW3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms