Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS45

Ccdc66, Coiled-coil domain-containing protein 66, mousemouse

Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc66Q6NS45 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc66Q6NS45 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc66Q6NS45 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms