Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CltbQ6IRU5 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CltbQ6IRU5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms