Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Krt40Q6IFX3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Krt40Q6IFX3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Krt40Q6IFX3 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms