Protein–RNA interactions for Protein: Q6I6G8

Hecw2, E3 ubiquitin-protein ligase HECW2, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw2Q6I6G8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Hecw2Q6I6G8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Hecw2Q6I6G8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Hecw2Q6I6G8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms