Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Nckap5lQ6GQX2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nckap5lQ6GQX2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms