Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Smarca2Q6DIC0 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Smarca2Q6DIC0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Smarca2Q6DIC0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Smarca2Q6DIC0 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms