Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Atp11bQ6DFW5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp11bQ6DFW5 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms