Protein–RNA interactions for Protein: Q6BCL1

Pram1, PML-RARA-regulated adapter molecule 1, mousemouse

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Length 675 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pram1Q6BCL1 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pram1Q6BCL1 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pram1Q6BCL1 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms