Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sv2cQ69ZS6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sv2cQ69ZS6 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms