Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.14■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Jmjd1cQ69ZK6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Jmjd1cQ69ZK6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms