Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZC8

Gpalpp1, GPALPP motifs-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpalpp1Q69ZC8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpalpp1Q69ZC8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gpalpp1Q69ZC8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms