Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Kiaa1549Q68FD9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Kiaa1549Q68FD9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms