Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Col4a5Q63ZW6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Col4a5Q63ZW6 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Col4a5Q63ZW6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms