Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Pou4f3Q63955 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pou4f3Q63955 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms