Protein–RNA interactions for Protein: Q63850

Nup62, Nuclear pore glycoprotein p62, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup62Q63850 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nup62Q63850 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nup62Q63850 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms