Protein–RNA interactions for Protein: Q62458

Gm20809, (clone BALB14N), mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20809Q62458 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Gm20809Q62458 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm20809Q62458 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm20809Q62458 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Gm20809Q62458 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm20809Q62458 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20809Q62458 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Gm20809Q62458 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm20809Q62458 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Gm20809Q62458 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm20809Q62458 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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