Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sp4Q62445 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sp4Q62445 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sp4Q62445 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sp4Q62445 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Sp4Q62445 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms