Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Ndufa4Q62425 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Ndufa4Q62425 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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