Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hoxa13Q62424 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Hoxa13Q62424 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms