Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Supt6hQ62383 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Supt6hQ62383 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.1 ms