Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Taf6Q62311 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Taf6Q62311 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms