Protein–RNA interactions for Protein: Q62280

Ss18, Protein SSXT, mousemouse

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18Q62280 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ss18Q62280 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ss18Q62280 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ss18Q62280 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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Ss18Q62280 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ss18Q62280 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ss18Q62280 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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Ss18Q62280 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Ss18Q62280 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ss18Q62280 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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