Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Kdm5dQ62240 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC35.32■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Kdm5dQ62240 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Kdm5dQ62240 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms