Protein–RNA interactions for Protein: Q62203

Sf3a2, Splicing factor 3A subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3a2Q62203 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sf3a2Q62203 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sf3a2Q62203 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a2Q62203 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a2Q62203 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a2Q62203 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a2Q62203 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a2Q62203 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a2Q62203 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Sf3a2Q62203 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms