Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rbm38Q62176 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rbm38Q62176 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms