Protein–RNA interactions for Protein: Q61361

Bcan, Brevican core protein, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BcanQ61361 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcanQ61361 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
BcanQ61361 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
BcanQ61361 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcanQ61361 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
BcanQ61361 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BcanQ61361 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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