Protein–RNA interactions for Protein: Q61205

Pafah1b3, Platelet-activating factor acetylhydrolase IB subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pafah1b3Q61205 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pafah1b3Q61205 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Pafah1b3Q61205 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms