Protein–RNA interactions for Protein: Q61179

Irf9, Interferon regulatory factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf9Q61179 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf9Q61179 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf9Q61179 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf9Q61179 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms