Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Foxg1Q60987 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms