Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cep250Q60952 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
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Cep250Q60952 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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Cep250Q60952 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cep250Q60952 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms