Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Mkrn3Q60764 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Mkrn3Q60764 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms