Protein–RNA interactions for Protein: Q60649

Clpb, Caseinolytic peptidase B protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClpbQ60649 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ClpbQ60649 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ClpbQ60649 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms