Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prdm1Q60636 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Prdm1Q60636 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms