Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CttnQ60598 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CttnQ60598 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CttnQ60598 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CttnQ60598 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CttnQ60598 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CttnQ60598 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CttnQ60598 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CttnQ60598 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CttnQ60598 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
CttnQ60598 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms