Protein–RNA interactions for Protein: Q60520

Sin3a, Paired amphipathic helix protein Sin3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3aQ60520 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Sin3aQ60520 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Sin3aQ60520 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms