Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rnf123Q5XPI3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
Rnf123Q5XPI3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rnf123Q5XPI3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms