Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Atp13a3Q5XF89 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp13a3Q5XF89 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms