Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
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Tdrd5Q5VCS6 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
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Tdrd5Q5VCS6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Tdrd5Q5VCS6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms