Protein–RNA interactions for Protein: Q5SX40

Myh1, Myosin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,942 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myh1Q5SX40 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Myh1Q5SX40 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Myh1Q5SX40 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Myh1Q5SX40 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms