Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ankrd40Q5SUE8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ankrd40Q5SUE8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms