Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSK3

Tefm, Transcription elongation factor, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TefmQ5SSK3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
TefmQ5SSK3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
TefmQ5SSK3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms